Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms