Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms