Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2NP61088 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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