Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP12-1P59990 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms