Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB38P57729 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB38P57729 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB38P57729 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB38P57729 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB38P57729 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB38P57729 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB38P57729 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB38P57729 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB38P57729 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB38P57729 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB38P57729 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB38P57729 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms