Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME5P56597 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME5P56597 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME5P56597 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NME5P56597 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms