Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA3P52797 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms