Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPFP49454 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPFP49454 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPFP49454 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms