Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT6CP48668 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms