Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms