Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATRXP46100 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATRXP46100 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATRXP46100 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms