Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms