Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A3P43003 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms