Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRPPRCP42704 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms