Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GJC1P36383 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJC1P36383 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJC1P36383 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms