Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPS1P31327 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPS1P31327 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPS1P31327 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPS1P31327 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms