Protein–RNA interactions for Protein: P30039

PBLD, Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBLDP30039 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBLDP30039 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBLDP30039 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBLDP30039 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBLDP30039 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBLDP30039 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBLDP30039 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBLDP30039 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBLDP30039 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBLDP30039 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBLDP30039 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBLDP30039 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBLDP30039 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBLDP30039 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms