Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms