Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB9P28065 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms