Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRZ1P23471 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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