Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMNB1P20700 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms