Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSPP15924 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSPP15924 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSPP15924 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSPP15924 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSPP15924 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSPP15924 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSPP15924 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms