Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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