Protein–RNA interactions for Protein: P11717

IGF2R, Cation-independent mannose-6-phosphate receptor, humanhuman

Predictions only

Length 2,491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2RP11717 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGF2RP11717 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms