Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3P09919 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3P09919 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3P09919 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms