Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEFLP07196 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms