Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms