Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNSO60931 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNSO60931 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNSO60931 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNSO60931 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms