Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms