Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNMO15061 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNMO15061 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNMO15061 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNMO15061 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNMO15061 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNMO15061 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNMO15061 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNMO15061 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNMO15061 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNMO15061 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNMO15061 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNMO15061 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNMO15061 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNMO15061 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms