Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SETD1AO15047 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SETD1AO15047 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms