Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVH48-1M5A8F1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms