Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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