Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms