Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAB39Q9Y376 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms