Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms