Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VANGL2Q9ULK5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VANGL2Q9ULK5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms