Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms