Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms