Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRBP1Q9P2E9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms