Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCHIP1Q9P0W5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms