Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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GDE1Q9NZC3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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GDE1Q9NZC3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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GDE1Q9NZC3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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GDE1Q9NZC3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GDE1Q9NZC3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GDE1Q9NZC3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GDE1Q9NZC3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GDE1Q9NZC3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GDE1Q9NZC3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GDE1Q9NZC3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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