Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EMILIN3Q9NT22 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms