Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms