Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms