Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBQLN4Q9NRR5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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