Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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