Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL4Q9C0H6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms