Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms