Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASEH2B-AS1-201ENST00000454605 1007 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009245.1-201ENST00000456481 862 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098679.3-203ENST00000514881 919 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091901.1-201ENST00000517722 736 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 808 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00852-201ENST00000475197 1328 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms